Statisticien (H/F) - Côtes-d'Armor (22)

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Publié par ANSES
Entreprise située à LA MEAUGON (22).

Description

Catégorie d'emploi Agent contractuel de catégorie 2
Type de contrat Contrat à durée déterminée de droit public de 9 mois
Localisation Ploufragan (22)
Prise de fonction Septembre 2019

Date limite de réponse : 17 mai 2019
Adresser les candidatures par courriel (lettre de motivation + cv) en indiquant la référence 2019-053

Sous l'autorité du chef de l'unité et en lien étroit avec le responsable scientifique de l'étude COLISEE consacrée à la colibacillose aviaire et dans le contexte d'une équipe dédiée, le travail du statisticien consistera à réaliser l'exploitation statistique de l'ensemble des données collectées dans le cadre de l'étude. Les objectifs de l'étude COLISEE menée par l'unité EPISABE de l'Anses (en collaboration avec l'UMT Sanivol ITAVI/ANSES, l'unité MBA et la plateforme Identypath de l'ANSES et les laboratoires RESALAB, FINALAB et LABOCEA), sont d'identifier les facteurs déclenchants de la colibacillose et de développer des outils analytiques de caractérisation des souches d'E. coli. Pour cela, une étude épidémiologique a été menée en 2018 dans 80 élevages de poulets (Enregistrement des pratiques d'élevage et collecte de prélèvements pour analyse E. coli) et les souches d'E. coli isolées ont été analysées par PCR Haut débit et spectrométrie de masse MALDI-TOF.

Il s'agit dans le cadre de ce poste de réaliser l'exploitation statistique de l'ensemble des données : données d'élevages et résultats d'analyses PCR (présence/absence de marqueurs génétiques) et MALDI-TOF (détection de pics moléculaires) des souches d'E. coli, pour répondre aux questions suivantes :
- Exploitation des résultats MALDI-TOF pour l'étude des profils moléculaires des souches d'E. coli (en analysant les spectres des souches selon les masses et les intensités des pics moléculaires).
- Recherche des associations entre les marqueurs génétiques PCR et certains pics moléculaires issus de l'analyse MALDI-TOF
- Evaluation de la diversité des isolats et étude de l'intérêt prédictif de la pathogénicité des profils de souches d'E. coli à partir des données PCR et MALDI-TOF ainsi que des données d'élevage.
- Recherche des facteurs de risque de la colibacillose aviaire à partir des données d'élevage et des profils des souches d'E. coli.
- Contribution à la valorisation des résultats (rédaction d'articles, congrès) et à la veille scientifique relative aux traitements statistiques dans le domaine de la santé animale
Ces traitements statistiques seront réalisés avec le logiciel R.

Compétences

Diplômes requis : De BAC+3 à BAC+5 en statistiques

Expériences similaires
- Expérience dans le traitement statistique des données grâce au logiciel R
- Motivation pour le traitement de données dans le domaine biologique
Compétences
- Compétences scientifiques et techniques :
Maitrise du logiciel R
Maitrise des méthodes statistiques : analyse de données, classification, modèle linéaire généralisé, statistiques bayésiennes
- Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe
- Capacités d'analyse, de synthèse et qualités rédactionnelles
- Maîtrise de l'outil informatique et de l'anglais scientifique
- Aptitude organisationnelle, rigoureux(se), dynamique et force de proposition

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